Cette saison démarre 8 mois après que Ninja soit devenue l'élève d'Orochimaru...
Le sannin, la futur mère et Kabuto se font attaquer par l'Akastuki à un trèèèèèès mauvais moment : Ninja va accoucher (si si ! ah j'vous jure les gosses ! -_-").
Peu après la naissance de l'enfant, l'équipe de sauvetage by Naruto et Soyra arrive... composée de ces 2 derniers, de Gamabunta, Neji, Shino, Ino, Kiba et Akamaru, Hinata, Shikamaru et Choji.
Ils ramènent Ninja à Konoha où elle retrouve Kura qui a passé les 8 derniers mois au Village Caché dont le nouvel et 6ème Hokage n'est autre que Naruto (après avoir fait assassiné le 3ème, Orochimaru a fait tuer le 5ème (Tsunade)).
Le petit Uzumaki-Tamanin se prénomme Minato et possède la même capacité que sa mère : il peut prendre à volonté son apparence de démon renard, sauf qu'à l'image de son père, il possède 9 queues.
Kura, elle, a eu le temps de faire connaissance avec les gens de Konoha en 8 mois.
Seya et Ouragane sont toujours à Shinonsei.
Toujours à l'hopital, Ninja se voit demander sa main par Naruto... elle saute de joie (aucune retenue -_-").
Malheureusement son sensei vient la chercher et elle repart avec lui avec Minato... mais elle est décidée à en finir... elle fait en sorte que l'Akastuki les retrouve, Kabuto fuit (par ordre d'Orochimaru). C'est au pied de la statue où sont reclus les Bijuus qu'Orochimaru meurt auprès de Ninja. Celle-ci réussit à fuir, grâce à Manad et Azua, et retourne à Shinonsei, accompagnée de Naruto.
Pendant ces 8 mois, Soyra était dans les îles Kenyanes, les îles des Amazones, où elle a suivit un entrainement spécial auprès d'une femme appelée "Sorcière des astres". La moitié de son âme est désormais une panthère noire du nom de Krystal.
Soyra (re)fait la connaissance de Kabuto et ils tombent sous le charme l'un de l'autre. Mais c'est ce qui va causer le désespoir de l'elfe, elle va couper son âme de son corps, comme si elle était morte. Pour la faire revenir, il faut aller voir la Sorcière des astres.
Elactan se fait enlever par l'Akastuki... il semblerait qu'il soit un traitre en réalité.
A Shinonsei les examens ninjas commencent, c'est à Kura, Seya, Ouragane et l'équipe de Ninja de faire leurs preuves.
Kura doit passer les épreuves des aspirants ninjas pour devenir ninja.
Ouragane et Seya doivent passer les épreuves des ninjas supérieurs pour devenir Juunins.
Ninja est examinatrice des épreuves.
Peu avant les épreuves écrites, Ninja et Nraruto s'engueulent : Ninja a utilisé une technique interdite d'Orochimaru, pour tuer un ninja ennemi. Naruto ne comprend pas pourquoi sa compagne est autant affectée de la mort de son sensei.
Kura réussi l'épreuve écrite grâce à Sidalgo qui va chopper les réponses dans la tête du sensei de l'eau.
Après cette épreuve Ninja et Naruto se réconcilie et Kabuto vient voir Ninja pour lui faire part de sa décision de ramener Soyra. (Ninja et Kabuto ne peuvent pas se sacquer et il y a une engueulade ! ^^).
Les épreuves se passent : on apprend qu'Ouragange est enceinte d'Anyû (ben oui, de qui d'autre ?), des jumeaux, désespérée elle doit renoncer à l'alcool (mais non elle est pas alcoolique ! elle est juste bois-sans-soif à ses heures), Seya fait la rencontre de Kiba... flash mutuel...
Kura s'engueule (une fois de plus ! XD) avec Neji, au sujet du baiser que Sidalgo lui a donné... Malheureusement Tenten a tout entendu, elle attaque Kura, cette dernière évite les armes de jets et poignarde Neji...
Neji n'est pas mort, mais Kura est en fuite vers Suna. Ninja et Naruto décide de la raisonner... Kura s'explique avec eux, tout est arrangé, Ninja et Naruto convaincront Neji que ce baiser n'était qu'un malentendu, et Ninja persuade Kura qu'elle et Sidalgo peuvent faire de grandes choses. Kura se dirige tout de même vers Suna où Gaara l'accueille et lui attribue sa soeur, Temari, pour maître, dans le but de l'entraîner aux épreuves pratiques, dans une dizaine de jours.
Jiraya s'incruste chez Ninja et Naruto, un soir de pluie, il annonce au Hokage que l'Akastuki se rapproche de Shinonsei, ce qui effraye grandement Ninja.
Kabuto ramène Soyra, puis retourne à Oto dont il est le 2ème Hokage depuis la mort d'Orochimaru. L'elfe brune fait la connaissance de Jiraya et Kakashi.
Les 3 ninjas mises aux épreuves les réussissent, mais NInja est de plus en plus inquiète et elle décide d'avancer la date du mariage...
Soyra est enceinte de Kabuto, lorsque Ninja et Naruto le découvrent dans leur propre maison, ils piquent une de ces fureurs (c'était pas beau à entendre...), mais pour Soyra; Ninja décide de faire un effort et de supporter Kabuto.
En ce début de fin de mars (j'adore mon français -_-"), Naruto et Ninja se marient. S'en suit une grande fête à laquelle tout le monde est convié (sauf Kabuto).
Des nouveaux liens se créer et se solidifient : Lee et Elentë, Uissia et Chôji, Kiba et Seya... Gaara et Kura (qui se sont déjà largement rapprochés)... Mais Sidalgo a dit à Gaara que Kura voulait partir à la recherche de son père... en fait Sidalgo a longuement parlé avec le kazekage sans que Kura le sache... elle s'enfuie de la fête.
Ouragane, en colère fait de même : elle n'en peut plus des "ne bois pas" "fais attention", pas d'alcool !", des autres, elle décide d'aller voir son cousin sur l'île elfqiue... pour cela elle appelle (invoque grâce à une flûte), Wind, un cheval qui, à l'image de Seiankû volant, marche sur l'eau. Mais elle se fait ramener par Shadow.
Diablo, la lung de Seya, tente de lui faire part de 2 pressentiments... l'elfe aux cheveux noirs n'en écoute qu'un seul.
Le lendemain des noces, Ninja se fait réveiller par Elactan qui lui dit que Soyra a absolument besoin de son aide. La sensei de la terre se ève et vérifie les dires :Soyra n'est pas dans le dôjô de la maison où elle loge depuis que le sensei du feu (grand-père de Shikamaru), la virée...
Elle suit le traitre dans la forêt où Pein et Konan l'attendent... (là elle a quand même était bête), au dernier moment Elactan change de camp, mais nInja n'y croit pas et le tue, elle se fait capturé par le duo de l'Akastuki. Ils l'amènent dans un des repaires de l'oragnisation, situé dans les ruines de Taki...
Mais Ninja est décidée à ne pas se laisser faire : elle utilise la technique Edotensei ("réincarnation des âmes" (technique que lui a appris Orochimaru) : elle invoque les 4 premiers Hokages de Konoha et celui-là même qui lui a enseigné cette technique.
Mais le combat de ninjutsu s'arrête là : un gars de l'Akastuki bloque son chakra...
Malgré le taijutsu de Ninja et les 5 revenants, le combat est gagné par l'Akastuki... Ninja disparait dans la statue de l'Akastuki après avoir entendu Naruto crier son nom.
En ce même début de matinée, Kura et Gaara s'explique... la jeune fille apprend que Sidalgo a cafté (une fois de plus) qu'elle aimait le kazekage...
Personnes, sauf Naruto, Kakashi et le lung Inyo ne sait le drame qui s'est joué dans les ruines de Taki...